接种之前给菌袋灭菌，可以采用高压蒸汽或常压蒸汽的灭菌方法
高压蒸汽灭菌的方法：菌袋在放入锅炉之前，要检查一下锅炉的压力、放气开关、密封圈是否正常，将锅内的冷空气要全部排出来，里面留有冷空气以免启动的时候，压力与温度不一致，影响灭菌效果。准备工作做好以后，把菌袋放进专用的筐内，摆放整齐放进锅炉内，不能堆放，以免灭菌不彻底，放置不要太密，以保证锅炉里面的蒸汽能够流动，之后再把锅门盖上，不能有漏气的现象。把高压蒸汽锅炉的压力调整到0.1~0.14兆帕，锅炉温度保持128度左右，利用锅内的高压蒸汽来杀灭细菌。
锅炉在通气升温加热时，要把排气阀关掉，使锅炉内的压力达到0.05兆帕时，把排气阀打开，将里面的空气排空，压力恢复到0，再关闭排气阀进行升温加热，锅炉有大量蒸汽产生，压力达到0.12兆帕，保持2.5个小时进行高温灭菌消毒。灭菌的时间到了以后，不用再给锅炉加热，里面的余温再蒸一段时间，让压力自然降下来，当压力降到0.05兆帕，就可以打开放气阀，如果压力太高，打开锅炉会产生压力差，造成菌袋破损。在灭菌的时候，菌袋上的棉塞要盖上一层塑料，以免从锅炉内拿出来时有温差，产生水珠流到棉塞上。
常压蒸汽灭菌的方法：常压的灭菌锅是由灭菌池、灭菌仓和蒸汽发生装置等设备组成，锅的内壁要求光滑，在升温时才能保持温度一致，锅的上面要设计成拱形，以利于蒸汽产生的水沿着锅壁流下来，不会打湿菌袋。先将灭菌锅预热一下，使里面的水分蒸发掉，温度保持一致，再把菌袋整齐的摆放进去，接着再给锅炉加热，3~4个小时的时间，使锅内的温度达到100度，维持5~7个小时。在高温灭菌的过程中，要通过蒸汽发生装置的加水口慢慢加水，才能补充水分产生蒸汽，在加水的时候，不能加得太多，以免锅内的蒸汽减少。灭菌时间到了以后，就要停止加热，用锅内的余温保持1~2个小时，等温度降下来以后，再将菌袋拿到冷却房等待接种。
提示：种用常压灭菌用的时间比较长，菌袋里面的营养料在高温下容易分解，在灭菌时，要根据营养料的原材性质合理掌控时间，既要起到杀菌的目的，也要避免养分流失。灭菌之前，要将锅内的冷空气和水分清除干净，锅内的死角有冷空气，影响温度上升，会造成燃料浪费，焖锅的时间不宜过长，以免蒸汽落在棉塞接口的位置，打湿里面的营养料。
菌袋经过接种，也是提高
黑木耳产量的一项关键因素
1、冷却：经过灭菌以后的菌袋，还有一定的余温，需要经过冷却处理才能进行接种，黑木耳的菌丝适合在低温环境下生长，没有耐高温的能力，在灭完菌以后，还不能马上进行接种，必须要将菌袋里营养料的温度调整到25度以下，才能进行接种操作，以免温度过高，会烫伤菌丝。为了更快的冷却，使营养料上层和下层的温度保持一致，最好是在接种室旁边规划一个冷却室，也不用多大的面积，可以根据需要接种量来规划，要求室内要通风，空气新鲜，有专业的冷却设备，灭菌以后的菌袋就可以直接存放在冷却室。冷却室在使用之前，要用臭氧机或紫外灯进行消毒，不能用化学药物进行熏蒸，以免产生药残留，影响菌丝的生长，用臭氧进行消毒，可以很快分解，不会产生残留。
2、接种的场所：接种室要求干燥、背风的环境，可以调节温度，在门口设一个过渡区，以供工作人员换衣服、换鞋、洗手消毒等操作，室内要安装紫外灯用来照明，用来接种的工作台要离地面80厘米，宽60~80厘米，长度可以根据接种室的面积来定，接种室在使用之前要消毒。种植规模较小的场地，也可以用接种箱，用木质的材料做成箱体，前面开三个窗安装上玻璃，箱体下面挖两个圆形的孔进行操作，里面有一个紫外线的灯，接种的时候就可以在箱内进行。
3、无菌接种：采取无菌接种对环境的要求比较高，室内和室外的洁净度，是接种顺利进行的基本保证。室外要减小粉尘的产生，定期消毒杀灭害虫，室内的环境要经常清洗，保持洁净，使用前要做好彻底消毒的措施，不能有细菌和污染物存在。接种之前，室内要用碳酸溶液喷洒一遍，工具经过消毒以后放进接种室，打开紫外线的灯照射1个小时。
无菌接种操作时，要点亮酒精灯，在火焰周围10厘米的范围内完成，里面的酒精要有较高的纯度，产生的火焰大。先用木椎在菌袋上打3~4个孔，孔的大小保持1.2~1.5厘米，深度1.8厘米，用接种棒点一些
菌种，放进打好的孔内，并用手轻轻地按紧，使菌种与孔壁完全接触，再用毛刷粘取液化后的石蜡涂抹穴口，凝固以后就可以封口。再把菌袋翻转过来，在背面打3个孔，用同样的方法进行点种。在打孔的时候，要控制好密度，根据菌袋的大小和营养料的材质灵活调整，一般保持在穴距6~7厘米，行距7~8厘米为宜，每个孔穴排列要错落有致，形成“品”字形的结构。如果是用接种箱，要在接种箱的玻璃上开1~2个透气孔，以防止在密封的环境下，酒精灯会熄灭。接种完成以后，要把接种口处理好，搬入到培养室进行养菌。
小窍门：接种前，要用到的酒精灯、木椎、棉球、消毒液、接种铲、打火机等工具都要准备好，看一下酒精灯里的酒精是否充足，操作人员最好在进接种室前，换上专业的衣服，带上口罩，以免灰尘和口气会对菌丝造成污染。接种前室内先要做好除尘的工作，可以把水装在喷雾器里，对室内喷洒一遍，在给接种室消毒时，也可以把菌袋和工具放入一起消毒。
灭菌、接种要注意的一些事项
不管是采用哪一种方法灭菌，锅炉内加热的时间要掌控好，不要为了追求灭菌效果而延长加热的时间，营养料中的材质不一样，高温灭菌的时间也不一样。锅炉内的常温升到100度时，尽量要缩短时间，长时间达不到灭菌温度会引起培养料中的杂菌生长，不利于菌丝成活。在接种的时候，室内要彻底消毒，达到无菌操作的要求，提前将要用到的菌种、工具准备好，当天挖出来的菌种，要在当天用完，不能长时间存放。接种过后，要检查孔穴的密封情况，如果封闭不严，孔穴周围就会产生杂菌，造成菌丝污染。
